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比较遗传学发现人类和禽类tRNA基因的丢失和保守
创建时间:2020-08-21     浏览次数:81


众所周知,病毒感染严格依赖宿主转移RNA(tRNA)进行病毒RNA的解码。然而,在许多物种中,并非所有的64种密码子均能找到与之对应的tRNA(基于不同的反密码子),参与遗传密码的解码,包括人类、大肠杆菌以及植物等。通过tRNA的摆动解码,许多生物可以利用大大少于64种的tRNA完成所有的64种遗传密码的解码,目前最少需要25种。

我们发现人类和主要家禽(鸡和鸭)的64种tRNA基因中有14种平行缺失,包括8种tRNA-A34NN和6种tRNA-G34NN。通过分析tRNA基因中关键基序的保守性,我们发现BoX A和BoX B作为基因内tRNA启动子,在人,鸡和鸭之间进化上高度保守。因此,通过相似的摆动解码和tRNA解码策略,病毒RNA的解码在人,鸡和鸭中是相似的。在这三种生物中,病毒尤其是禽流感病毒可以交叉感染(Pepin等,2010)。对于多宿主病毒,不同的宿主可能会同时使用相似的病毒RNA解码策略。本研究暗示了宿主tRNA的遗传丢失和保守性与病毒跨宿主感染方面的分子机制。相关研究结果以“Evolutionarily missing and conserved tRNA genes in human and avian”为题发表在Infection, Genetics and Evolution杂志,DOI: 10.1016/j.meegid.2020.104460:104460。