近日，岗位专家黄琳凯团队以四川农业大学为第一完成单位在植物领域知名期刊《Plant Biotechnology Journal》（中科院一区TOP，IF=13.8）在线发表了题为 “Milletdb: a multi‐omics database to accelerate the research of functional genomics and molecular breeding of millets”的论文，建立了我国首个以牧草为主的多组学数据库平台——Milletdb（http://milletdb.novogene.com/）。

美洲狼尾草一类的millets是抗非生物胁迫能力强、营养丰富的禾本科优质牧草及粗粮，可保证生活在极端气候条件地区人们的粮食安全，同时也可为其它作物提供了与抗非生物胁迫有关的遗传资源。今年正好是联合国Millets年（International Year of Millets 2023）。随着组学技术的快速发展，相关数据量日益激增，但对于大部分科研工作者来说，利用数据快速挖掘基因仍是挑战，目前尚未有一个全面、系统的millets多组学数据分析平台可供使用。

团队开发的Milletdb是迄今为止最全面的millets类以及狼尾草多组学数据库，包含millets一类7个属的基因组和1800份不同的组学数据，包括了图形泛基因组学、基因组、转录组学、表观基因组学、变异组学和表型组学等数据。Milletdb还集成了20种实用工具，可以帮助用户从多角度（同源搜索、序列blast、性状）快速识别单个基因，从多个层面（转座子、转录因子、表达水平、蛋白水平）构建调控网络，并表征基因集（序列特征、表达模式、功能富集），可快速查找候选基因及基因的相关信息，有效助推狼尾草类的基因功能研究和分子育种进程。

四川农业大学博士生孙敏、弗吉尼亚理工大学/佐治亚大学严海东博士后、四川农业大学研究生张爱玲为该论文的共同第一作者，四川农业大学黄琳凯教授和福建农林大学朱方捷教授为论文的共同通讯作者。此次研究受到了国家自然基金、国家牧草产业技术体系、四川省饲草创新团队、四川省育种攻关等项目资助。

论文链接：https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/pbi.14136