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育种芯片可以提高育种效率,但在狼尾草属中,此前尚无一款成熟的、功能位点与背景位点相结合的育种SNP芯片。针对这一短板,团队在前期重要性状关联分析基础上,成功研发出狼尾草属象草和美洲狼尾草育种液相SNP芯片,填补了该领域的工具空白。
2026年5月,Grass Research 在线发表了黄琳凯团队题为A 10K liquid-phase single nucleotide polymorphism array for genetic diversity analysis and cultivar identification in elephant grass and its hybrid的方法论文,该研究成功开发了狼尾草属两款育种液相SNP芯片,为狼尾草分子育种提供了高效、低成本的新工具。
开发的象草育种芯片包含11,486个标记,覆盖全基因组14条染色体,并精准靶向504个与重要性状紧密连锁的功能基因位点。其中,涉及产量调控的位点55个(涵盖干重、鲜重等性状)、饲用品质相关位点 178个、植株抗逆性相关位点 165个,以及叶色性状相关位点106个。
此外,团队还开发了美洲狼尾草育种芯片,该芯片包含10,625个标记,覆盖全基因组7条染色体,并精准靶向992 个与关键农艺性状紧密连锁的功能基因位点。其中,涉及生物产量的位点 804个、饲用价值相关位点129个、植株抗性相关位点22个。两款育种芯片,可以降低基因分型成本60%,节约算力资源30%,已经广泛应用于品种鉴定、遗传多样性分析、全基因组选择育种和分子标记辅助育种。
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